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URL:https://murmitoyen.com/events/vanille/udem/detail/799161-seminaire-etud
 iant-avec-m-dominic-lauzon-groupe-vallee-belisle
LOCATION:Pavillon Roger-Gaudry \, 2900\, boul. Édouard-Montpetit\, Local M
 -415\, Montréal\, QC\, Canada
SUMMARY:Séminaire étudiant avec M. Dominic Lauzon (Groupe Vallée-Bélisl
 e)
DESCRIPTION:Titre : Règles thermodynamiques et cinétiques pour l'assembla
 ge et la régulation de nanomachines polymoléculaires à base d'ADN'. 
\
 nEndroit : Pavillon Roger-Gaudry\, salle G-415 à 11 h 
\nCette confér
 ence sera prononcée par Monsieur Dominic Lauzon\, candidat au doctorat d
 u laboratoire du Professeur  Alexis Vallée-Bélisle\, au Département de
  chimie\, de l'Université de Montréal.
\n
\nInformations supplémentaire
 s Lab. Vallée-Bélisle
\nAnnonce PDF du séminaire
\n
\nLes nanomachines 
 sont des assemblages nanométriques de molécules \; (ex: ADN\, ARN\, prot
 éine) qui produisent un mouvement quasi-mécanique (output) en présence 
 de stimulus spécifique (input) [1]. Ces nanomachines servent autant pour 
 le développement de stratégie en délivrance de médicament\, que pour l
 a détection de marqueur de maladies ou pour déclencher des évènements 
 en bio-informatique. Étant donné sa grande programmabilité\, l’ADN es
 t une biomolécule de choix pour la création de nanomachine. Toutefois\, 
 avec l’augmentation rapide de la complexité des nano-assemblages d’AD
 N\, il devient maintenant crucial d’optimiser le rendement de formation 
 et la régulation de ces nanomachines afin de rendre plus accessible leur 
 application à grande échelle. (Ex. imagerie in vivo et production de mas
 se de transporteurs moléculaires). [2]
\nPour répondre à ce problème\,
  il est important de mieux comprendre la thermodynamique et la cinétique 
 d’assemblage de ces nanomachines.   Pour ce faire\, j’ai utilisé une
  approche de simulation numérique afin d’étudier plusieurs scénarios 
 d’auto-assemblage en modifiant les constantes d’équilibre et les cons
 tantes de vitesses du système. Ces simulations numériques ont permis de 
 déterminer des conditions expérimentales intéressantes qui ont ensuite 
 été validé en laboratoire avec une nanomachine d’ADN contenant un\, d
 eux ou trois brins d’ADN. En incorporant des nucléotides modifiés avec
  un fluorophore et un quencher dans les brins d’ADN\, il est possible de
  suivre la formation de la nanomachine dans différentes conditions par sp
 ectroscopie de fluorescence ou par électrophorèse sur gel. D’ailleurs\
 , en modifiant la teneur en pair AT/GC\, la longueur du linker ou la temp
 érature\, il est aussi possible de modifier de façon contrôlée les con
 stantes thermodynamiques et la vitesse d’hybridation ou de déshybridati
 on de l’ADN. Les résultats expérimentaux illustrent pourquoi certaines
  nanomachines d’ADN ne peuvent pas s’assembler avec un rendement quant
 itatif. De plus\, les résultats démontrent qu’un bon contrôle sur l
 ’auto-assemblage permet de réguler l’activité de cette dernière\, e
 n introduisant un mécanisme de rétro-inhibition par exemple. Dans le fut
 ur\, ces travaux serviront de base théorique pour le développement d’u
 n biocapteur polymoléculaire inspiré de l’hémoglobine. J’utiliserai
  aussi ces observations afin d’introduire un niveau de régulation suppl
 émentaire à l’activité d’un DNAzyme qui catalyse le clivage d’un 
 lien phosphodiester d’un ribonucléotide. Le tout pave la voie vers un m
 eilleur contrôle dans l’assemblage et la régulation de nanomachines à
  base d’ADN.   [1] Ballardini\, R. et al. Acc. Chem. Res. 2001\, 34\, 4
 45-455.[2] Tørring\, T. et Gothelf\, K.V. F1000Prime Reports 2013\, 5\, 1
 4.
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